底仓套利是这样的，如果投资者看好某一种指数，比如上证50（000016），又比如内地银行（399947），那么可以通过买入对应份额的分级基金。
例如，4月28日上市的，鹏华基金公司的160631 银行指基所对应的A类和B类，配对比例是5:5。因此只要按1：1的份额买进A类和B类，就相当于是买入了母基。（注意是相同的份额，不是相同的金额）。
如果观察到当日收盘前出现溢价空间，那么投资者可以立即卖出B，接着再卖出A。（记住先卖B再卖A）与此同时，申购母基即可。
注意点：
1、底仓就是持仓，需要一直承受母基的净值变化。所以，除非看好该指数，否则不要买入底仓。投资者愿意承担母基净值变化的收益和风险，才值得买入底仓进行套利。
2、一定是当日收盘前观察并操作。因为我们套利套的是利，所以尽量减少可能的市场波动才是王道。例如，早上出现溢价空间，此时卖出A+B。但是下午指数大涨，使得B类的价格以及母基的净值都大涨，折腾下来反而搞砸了。
3、底仓套利，在跟踪对应指数的同时，获取额外的套利空间，所以能够拿到比指数基金更高的收益。各家指数基金的合同都有规定，建仓完毕后，尽量使得净值跟踪指数的偏差不超过5%。如果一个月有两次套利机会，每次获利2%，那么一年下来也有24%的相对收益（当然这个收益比较乐观）。
4、如果是在收盘前操作，那么基本上在几分钟之内即可锁定套利空间，不需要像溢价套利和折价套利那样承担一个交易日的波动。而且这种方式，套利速度最快，面对套利盘的打击较小，不会出现踩踏。
5、底仓套利方式，不需要像A+H股搬砖，可转债搬砖那样，留有一定的备用资金才可以搬。备用资金的使用效率很低，会拉低总收益。底仓套利先卖出A+B，此时已经得到了资金，再用资金去申购母基即可——不需要任何备用资金来完成“搬砖”。
6、底仓套利当日申购的母基，在次日盲拆，第三日早盘即变成A+B，又可进入下一个底仓套利周期。
7、底仓套利，判断母基的仓位，以及当日的收盘净值是关键。如果套利空间过低，建议不要操作，不然最后变成给基金公司和券商打工了。
8、一定是建仓完毕的分级基金。何谓“建仓完毕”？在基金募集合同或招募说明期里，有说明建仓期，一般为6个月，也有3个月的。也就是说在这个时限结束后，基金就必须将收益咬定指数，不能再上下来回折腾仓位了。
关于底仓套利的软件操作办法，参见溢价套利。以上所说的底仓套利，实际只是底仓溢价套利。还有一种底仓套利，是利用合并套利进行。但这种套利方法，就需要备用资金。在下一节中讲述折价套利时，还将提到。
PS：也正是底仓套利的方法，对于新上市的分级基金来说，还存在一种认购套利。即最开始就参与基金的认购，在A+B份额上市后第一天即可随时抛出。这样比其他套利资金跑得更快，风险更小——因为新基金刚上市未建仓，即便套利失败，也没有净值损失。套利者的损失也就是路费。
缺点：从认购结束到上市，需要等半个月以上。但根据现在的行情来看，拿到3%以上的套利空间（扣除申购费）是妥妥的，好于打新——认购额过大的分级基金除外。
（来源：雪球）
